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O projeto
Proteômica, inteligência artificial e One Health para enfrentar problemas de saúde pública no Paraná.
Uma rede proteômica para o Paraná
O NAPI Proteômica (título oficial: NAPI Proteômica: Sinergia Científica a Serviço da Saúde Pública no Paraná) é um arranjo de pesquisa e inovação coordenado pelo Instituto Carlos Chagas – Fiocruz Paraná e financiado pela Fundação Araucária.
O objetivo é enfrentar microrganismos multirresistentes e outros problemas de saúde pública no estado de forma integrada, multidisciplinar e translacional, sob a abordagem One Health, criando um Atlas computacional interativo para medicina de precisão e vigilância em saúde, e formando e fixando jovens pesquisadores em espectrometria de massas e inteligência artificial.
One Health
Saúde humana, animal e ambiental são interdependentes. Por isso a rede reúne microbiologia médica, proteômica, imunologia, medicina veterinária e inteligência artificial, incluindo coleta de amostras ambientais e de campo.
IA e espectrometria de massas
A proteômica computacional (espectrometria de massas de alta resolução + bioinformática + IA) é o diferencial da rede. O grupo da Fiocruz Paraná desenvolve ferramentas usadas internacionalmente.
Atlas Vivo do Paraná
Ambiente computacional para compartilhar e analisar dados proteômicos do estado com inteligência artificial. É um produto novo do projeto, construído a partir do DiagnoMass e do PatternLab for Proteomics, hospedado na infraestrutura do ICC.
DiagnoMass
Tecnologia de diagnóstico baseada em espectrometria de massas, em operação, base computacional do Atlas e aplicada ao diagnóstico de tumores como gliomas.
PatternLab for Proteomics
Ambiente de análise proteômica desenvolvido na Fiocruz Paraná e de amplo uso internacional.
Scout e SequenceAssembler
Scout: motor de busca de alta velocidade para cross-linking (XL-MS), publicado na Nature Methods. SequenceAssembler: reconstrução de sequências de proteínas a partir de dados de espectrometria de massas (Journal of Proteomics).
Linhas de atividade
| Meta | Atividade | Liderança |
|---|---|---|
| 1 | Bioinformática para interações proteína-proteína em larga escala por cross-linking | Paulo C. Carvalho |
| 2 | Bioinformática proteômica para vigilância e diagnóstico; doenças do sistema nervoso e organoides | Marlon Dias e Milan Clasen |
| 3 | Proteômica aplicada ao câncer, integrada ao Genomas Paraná | David L. A. Figueiredo |
| 4 | Diagnóstico rápido de resistência antimicrobiana (LACEN-PR) | Marcelo Pillonetto |
| 5 | Coleta ambiental e de campo em abordagem One Health | Fabiano B. Figueiredo |
| 6 | Diagnóstico de baixo custo: MIPs, IgY e testes de ácidos nucleicos | Sueli F. Y. Ogatta |
| 7 | Diagnóstico precoce de infecções fúngicas por vesículas extracelulares | Márcio L. Rodrigues |
| 8 | Rede Paranaense de Proteômica: encontros periódicos e workshops | Paulo C. Carvalho e Marlon Dias |
| 9 | Proteômica single-cell e organoides cerebrais com a UC San Diego | Paulo C. Carvalho e Marlon Dias |
Indicadores previstos no plano de trabalho
- Ao menos 20 artigos em periódicos de alto impacto.
- Formação de 25 novos mestres e doutores em proteômica, IA e bioinformática.
- Instalação de um espectrômetro de massas de última geração como recurso compartilhado do estado (concluída em 2026).
- Educação continuada em proteômica, espectrometria de massas e IA, e a criação da Rede Paranaense de Proteômica.
Como a rede é gerida
O Conselho Gestor é a instância deliberativa do NAPI. Reúne o coordenador geral e os subcoordenadores regionais, define prioridades e metas, aprova editais de bolsas e acompanha a execução. Pelo estatuto, reúne-se trimestralmente.
A coordenação geral cabe a Paulo Costa Carvalho (Fiocruz Paraná), com apoio de uma gerência administrativa.
Dados do projeto
| Financiador | Fundação Araucária – programa NAPI |
|---|---|
| Instrumento | Convênio PDI 467/2025 |
| Execução científica | Instituto Carlos Chagas – Fiocruz Paraná |
| Convenente | Instituto para Pesquisa do Câncer de Guarapuava (IPEC) |
| Período | Novembro de 2025 a outubro de 2028 |
| Áreas | Biotecnologia & Saúde; Transformação Digital (transversal) |